Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms