Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl4P14097 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl4P14097 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl4P14097 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl4P14097 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl4P14097 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl4P14097 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl4P14097 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl4P14097 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl4P14097 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl4P14097 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms