Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrgnP13609 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms