Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prf1P10820 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms