Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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