Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P10404 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P10404 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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