Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf1P09925 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Surf1P09925 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms