Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefmP08553 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefmP08553 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NefmP08553 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NefmP08553 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NefmP08553 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NefmP08553 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NefmP08553 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NefmP08553 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms