Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TtrP07309 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TtrP07309 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TtrP07309 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TtrP07309 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TtrP07309 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtrP07309 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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