Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl1P05977 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl1P05977 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms