Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01740 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01740 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01740 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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