Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01667 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01667 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01667 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms