Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp8O89110 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms