Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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