Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp1O89090 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms