Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms