Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms