Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms