Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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