Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3dO70194 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3dO70194 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms