Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ldb2O55203 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ldb2O55203 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ldb2O55203 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ldb2O55203 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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