Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dsg2O55111 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg2O55111 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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