Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms