Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaluO35887 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaluO35887 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CaluO35887 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CaluO35887 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CaluO35887 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaluO35887 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms