Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RaxO35602 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RaxO35602 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RaxO35602 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RaxO35602 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RaxO35602 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RaxO35602 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RaxO35602 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RaxO35602 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RaxO35602 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RaxO35602 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RaxO35602 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms