Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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