Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms