Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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