Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms