Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms