Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx2O08686 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barx2O08686 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barx2O08686 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barx2O08686 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barx2O08686 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barx2O08686 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms