Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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