Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6401L7N2C0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6401L7N2C0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6401L7N2C0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6401L7N2C0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6401L7N2C0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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