Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6871L7N248 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms