Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms