Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms