Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3542K7N6U2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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