Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms