Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer2J3QPU5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms