Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10428J3QNV7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms