Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms