Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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