Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms