Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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