Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms