Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms