Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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