Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms