Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pate1E9Q658 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms