Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms